成人急性髓系白血病基因突变特点及与预后等相关因素分析

目的:回顾性分析我院初治成人急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML)患者的二代测序结果和预后生存,探讨成人AML患者基因突变特点及影响预后的相关因素。方法:收集2019年1月至2023年2月期间就诊于南昌大学第二附属医院的初治成人AML(APL除外)患者的临床资料。通过二代测序(Next-generation sequencing,NGS)进行基因突变谱检测,并分析:1)AML患者基因突变的一般临床特点;2)总体基因突变的分布及突变位点特点;3)不同基因突变之间的关系及其在不同年龄组间分布的差异;4)AML患者基因突变与染色体核型的关系;5)基因突变对诱导化疗反应率的影响;6)不同基因突变患者预后生存的差异。应用SPSS25.0、Graphpad prism8.0、Origin软件进行统计分析。结果:(1)一般临床资料结果:本研究共收集150例初治AML患者,男女比例大约为1.34:1(86:64),中位年龄为56.50岁(18-83岁),<60岁有85人,≥60 岁有65人。FAB分型中 M0 4例(2.67%),M117例(11.33%),M2 60例(40%),M4 24 例(16%),M5 35 例(23.33%),10 例未分型(6.67%)。FLT3-ITD 基因突变阳性患者初诊时外周血白细胞计数、骨髓原始细胞比例、乳酸脱氢酶均高于FLT3-ITD基因突变阴性患者,TET2基因突变阳性患者初诊时外周血WBC计数、Hb值均高于TET2基因突变阴性患者,NPM1基因突变阳性患者初诊时外周血WBC计数、骨髓原始细胞比例均高于NPM1基因突变阴性者,差异有统计学意义。(2)150例患者的NGS结果显示:132例患者检测到突变基因,检出率为88%,基因突变阳性患者中最少1个,最多检出11个基因突变位点。与<60岁患者相比,≥60岁患者更易同时发生5个及以上的多个位点突变,差异有统计学意义。(3)研究结果显示,突变率最高的前5种突变基因为:NPM1突变(33例,占 22.00%)、FLT3-ITD 突变(33 例,占 22.00%)、TET2 突变(31 例,占20.67%)、DNMT3A 突变(27 例,biological half-life占 18.00%)、NRAS 突变(21 例,占 14.00%)。<60岁患者中突变率最高的前5种基因为NPM1突变(17例,占20.00%)、FLT-ITD 突变(17 例,占 20.00%)、DNMT3A 突变(13 例,占 15.29%)、NRAS突变(12例,占14.12%)、TET2突变(11例,占12.94%)。≥60岁患者中突变率最高的前5种基因为:TET2突变(20例,占29.41%)、NPM1突变(16例,占 24.62%)、FLT3-ITD 突变(16 例,占 24.62%)、DNMT3A 突变(14 例,占21.54%)、ASXL1突变(13例,占20.00%)。将突变基因按照年龄段分组进行统计学分析结果示,TET2突变、ASXL1突变、RUNX1突变、SRSF2突变在≥60岁的AML患者中突变频率显著增高,差异有统计学意义,而GATA2突变往往在<60岁患者中突变频率显著增高,差异有统计学意义。(4)将突变基因按照染色体核型分组结果示,KIT突变在预后良好核型组最常见,占33.33%(4/12),预后中等核型组突变频率最高的是NPM1突变,占27.62%(29/105),预后不良核型组突变频率最高的是TP53突变,占37.04%(10/27)。NPMI突变、DNMT3A突变和FLT3-ITD突变、SRSF2突变在预后中等核型组中突变频率显著增高,差异有统计学意义,而TP53突变、PTPN11突变更常见于预后不良核型组,差异有统计学意义。正常核型中NPMl、CEBPA突变率显著高于异常核型患者,而异常核型中ASXL1突变率显著增高,差异有统计学意义。(5)研究显示,不同突变基因之间存在共存和互斥现象。如NPM1突变与FLT3-ITD突变、NPM1突变与DNMT3A突变、ASXL1突变与RUNTezacaftor使用方法X1突变之间存在显著共存关系。FLT3-ITD突变与TP53突变、TET2突变与IDH2突变、CEBPA突变与NPM1突变之间存在显著互斥关系。(6)研究显示,NPM1和PTPN11阴性组诱导化疗的CR率+CRi率明显高于阳性组,单基因突变组有较低的诱导缓解率,≤2个基因突变组有较好的诱导缓解率,差异有统计学意义。(7)单因素分析显示,年龄、诱导化疗后疗效、FLT3-ITD突变、DNMT3A突变、PTPN11突变、单基因突变、≤2种基因突变对OS的影响有统计学意义,而年龄、诱导化疗后疗效、NPM1突变、FLT3-ITD突变、DNMT3A突变、单基因突变、≤2种基因突变、≤3种基因突变对RFS的影响有统计学意义。多因素Cox回归分析结果提示:年龄、诱导化疗后疗效、FLT3-ITD、DNMT3A突变是影响成人AML患者OS、RFS的独立因素。结论:1、基因突变的临床参数有特异性。FLT3-ITD突变在临床上多表现为初诊时高外周血WBC计数、高骨髓原始细胞比例、高LDH。TET2基因突变表现为初诊时高外周血WBC计数、高Hb值,NPMl突变表现为初诊时外周血高WBC计数、高骨髓原始细胞比例。2、≥60岁患者更易同时GW-572016使用方法发生5个及以上的多位点突变。3、成人AML突变基因在不同年龄段的突变频率不同,TET2突变、ASXL1突变、RUNX1突变、SRSF2突变在<60岁患者中更多见,而GATA2突变在<60岁患者中有明显增高趋势。4、不同突变基因之间存在共存和互斥现象。NPM1突变与FLT3-ITD突变、NPM1突变与DNMT3A突变、ASXL1突变与RUNX1突变之间存在显著共存关系。FLT3-ITD突变与TP53突变、TET2突变与IDH2突变、CEBPA突变与NPM1突变之间存在显著互斥关系。5、成人AML患者的基因突变在不同核型组发生频率不同。KIT突变在预后良好核型组中最常见,NPMl突变、DNMT3A突变和FLT3-ITD突变在预后中等核型组中常见,而TP53突变、PTPN11突变更常见于预后不良核型组。正常核型中NPMl突变、CEBPA突变常见,而ASXL1突变常见于异常核型中。6、NPM1和PTPN11阴性组诱导化疗缓解率(CR率+CRi率)明显高于阳性组,单基因突变组有较低的诱导缓解率,≤2个基因突变组有较好的诱导缓解率。7、年龄、诱导化疗后疗效、FLT3-ITD突变、DNMT3A突变是影响成人AML患者OS、RFS的独立因素。