目的:为了解滇西地区汉坦病毒(Hantavirus,HV)的宿主动物和感染现状,掌握HV分布、基因型和遗传进化特征,为肾综合征出血Biomass by-product热的预防、控制及宿主动物的监测,提供科学指导。方法:采用夹夜法和笼夜法,在大理市洱海周边乡镇、怒江州中缅边境泸水市片马镇和贡山县茨开镇与独龙江乡,捕获鼠形动物并解剖,取心、肝、脾、肺、肾、肠留存,其中肺组织用于提HV核酸。采用形态学鉴定和扩增细胞色素b基因,对物种进行鉴定。采用逆转录RT-PCR方法来检测HV的感染情况,阳性样本送公司高通量测序或自行设计特异性引物进行PCR扩增,以便获得HV基因组。采用Excel对数据处理和统计分析,用Arc Map 10.8进行地图的制作,用Lesergene、Geneious、GENEDOC、MEGA-X、Clustal W等软件对序列进行处理和遗传进化分析。结果:2020年10月～2022年9CP-690550体内月,在大理市洱海周边乡Belnacasan镇、怒江州中缅边境泸水市片马镇和贡山县茨开镇与独龙江乡,共采集4目7科451只鼠形动物。经RT-PCR检测发现11只鼠形动物HV阳性,感染率为2.44%(11/451)。3个地区的感染率由高到低的分别为泸水市7.69%、贡山县1.92%、大理市1.57%;鼠形动物感染率由高到低依次为:四川短尾鼩(Anourosorex squamipes)14.29%(2/14)、小长尾鼩鼱(Episoriculus macrurus)10.00%(1/10)、大长尾鼩鼱(Episoriculus leucops)7.69%(1/13)、大足鼠(Rattus nitidus)6.66%(1/15)、克钦绒鼠(Eothenomys cachinus)4.49%(4/89)、褐家鼠(Rattus norvegicus)2.00%(1/50)和黄胸鼠(Rattus tanezumi)0.95%(1/105)。同源性分析结果,所有11份阳性样本核苷酸同源性为65.2%～99.7%,氨基酸同源性为60.9～100%。系统发育结果,共形成4个分支,其中来自大足鼠的DL52、来自褐家鼠的DL64和来自黄胸鼠的DL90与汉城正汉坦病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV)亲缘关系最近,聚在一起;来自克钦绒鼠的PM2、PM33、PM34、PM37与福贡正汉坦病毒(Fugong orthohantavirus,FUGV)聚在一起,形成一个分支;来自四川短尾鼩的GS165、GS175与高平正汉坦病毒(Cao Bang orthohantavirus,CBNV)亲缘关系较近,属于同一分支上;而来自小长尾鼩鼱的GS63、大长尾鼩鼱的GS159与索拉帕拉雅病毒(Thottopalayam thottimvirus,TPMV)密切相关,但它们处于独立的进化分支。结论:1.在本研究中共发现SEOV、FUGV、CBNV、TPMV 4种HV,滇西部分地区存在HV的遗传多样性。2.本研究在2目3科7种宿主动物中发现HV。在啮齿目的大足鼠、褐家鼠、黄胸鼠,仓鼠科的克钦绒鼠,以及食虫目鼩鼱科的四川短尾鼩、小长尾鼩鼱和大长尾鼩鼱都发现HV。滇西部分地区HV宿主动物也呈现多样性分布。3.首次在云南省的小长尾鼩鼱、大长尾鼩鼱中检测到索托帕拉雅病毒属(Thottimvirus)病毒,发现的病毒为一种新的HV,暂命名为“贡山病毒(Gongshan virus,GOSV)”。4.大理洱海周边地区鼠形动物携带的HV有感染人的风险。5.首次在克钦绒鼠中发现FUGV。