基于生物信息学分析探究食管鳞状细胞癌的关键通路、基因及免疫细胞浸润

目的：利用生物信息学方法系统全面的探索食管癌中的差异表达基因以及Barasertib免疫细胞特征。方法：获取GEO数据库中4个食管癌数据集并进行差异分析。进行Gene Ontology（GO）功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and GenomesCH-223191生产商（KEGG）通路注释；分别利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用（PPI）网络图以及Cytoscape 软件的6种算法筛选核心基因。利用GEPIA2数据库对核心基因进行生存分析。采用TIMER2数据库和CIBERSORT反卷积算法进行免疫浸润分析。结果：共筛选出244个差异表达基因（DEGs），其中上调基因164个，下调基因80个。GO分析发现，DEGs主要富集在胞外区和细胞外间隙，与肿瘤侵袭转移相关。KEGG结果显示DEGs与PI3K-Akt信号通路和细胞外基质（ECM）受体相互作用信号通路相关。通过差异基因的蛋白相互作用分析，我们发现3个核心基因CXCL8、MMP9和MMP13在ESCC中高表达。免疫浸润结果显示，巨噬细胞和静息树突状细胞显著增加，而肥大细胞和单核细胞显著减少。结论：筛选出的EOdontogenic infectionSCC核心基因和免疫浸润细胞可能在肿瘤中起着重要作用，有望成为ESCC潜在的肿瘤标志物且用于ESCC的诊断和治疗。