植物根茎过渡区(root-stem transition zone，RSTZ)将根和茎相互连接，其发育形态决定了大豆的地上部株型和抗倒伏潜力。本研究通过EMS诱变获得一个RSTZ弯曲或旋转的大豆突变体M_(rstz)，其形态特征能够稳定遗传，是探究大豆茎秆发育规律的特异材料。将该Cell Analysis突变体和栽培大豆中黄13杂交构建重组自交系群体，对群体中直立和弯曲型后代的RSTZ进行解剖结构比较，发现弯曲型株系比直立型株系的维管形成层较宽、次生木质部细胞层数较多、细胞形状不规则，表明维管组织分化可能是导致RSTZ形态发生差异的重要因素之一。进一步化学组分测定发现，木质素和粗纤维含量越高越不易弯曲。选取RIL群体中弯曲型和直IACS-010759分子量立型2种极端株系进行BSA-Seq，采用SNP-index和InDel-index关联分析方法鉴定到调控RSTZ形态的关联区域Chr19：43030943～45849854，该区间共含有319个基因。结合生物信息学分析、基因注释信息和表达丰度分析筛选到7个候选基因，分别为Glyma.19G170200、Glyma.19G201500、Glyma.19G187800、Glyma.19G178200、Glyma.19GPCI-32765197000、Glyma.19G179100、Glyma.19G196900。其中，Glyma.19G187800、Glyma.19G178200和Glyma.19G196900在大豆驯化中潜在影响RSTZ形态建成。本研究不仅为解析大豆RSTZ组织形成及其遗传基础提供了材料基础，并为进一步挖掘调控大豆茎秆发育基因提供新的见解。